Investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Navarra forman parte del Instituto de Investigación Sanitaria de Navarra (IDISNA), un espacio biomédico multidisciplinar y traslacional para la investigación básica clínica, epidemiológica y en servicios de salud. En la institución, que está pendiente de ser acreditada por el Instituto Carlos III, participan el Servicio Navarro de Salud, el Complejo Hospitalario de Navarra, el Instituto de Salud Pública y Laboral de Navarra, Navarrabiomed-Fundación Miguel Servet, la Universidad de Navarra, el Centro de Investigación Médica Aplicada y la Clínica Universidad de Navarra.

La labor de IDISNA se organiza en torno a 100 grupos y 9 áreas que son "Oncología y hematología", "Atención primaria", "Enfermedades cardiovasculares", "Aparato digestivo y metabolismo", "Neurociencias", "Salud mental", "Enfermedades inflamatorias inmunes e infecciosas", "Epidemiología y salud pública" y "Terapias avanzadas e innovaciones diagnósticas". En total, 759 investigadores desarrollan su labor en IDISNA cuyo objetivo es elevar la calidad de la investigación y la asistencia y docencia biomédica de Navarra. Hasta ahora, los miembros del Instituto ya han realizado más de 300 artículos y más de 3300 publicaciones en los últimos 5 años.